分析系统及测序平台

分析系统

宏微 RPD-seq® Server 是由赛哲生物自主研发的、针对病原微生物宏基因组检测产品的、集样本管理-数据分析-数据管理于一身的专业生物信息分析平台,可实现病原微生物宏基因组检测数据的快速分析,满足科室内多用户共用测序仪进行各自数据分析并保证每个用户数据保密性以及本地化操作的临床需求。

RPD-seq® Server 六大优势

  • 分析本地化
  • 报告自动化
  • 操作界面化
  • 数据保密化
  • 流程模块化
  • 管理统一化

实验室构建

赛哲提供「实验室测序平台+分析系统」构建服务,可协助客户单位构建标准化、专业化、一体化的微生物测序平台,欢迎咨询:400-888-4242(转1)

资源 1

测序平台

赛哲生物与全球测序领域巨头illumina公司签订了《临床诊断产品商业化与供应协议》,达成战略合作,开展微生物领域的检测项目。

赛哲生物是illumina中国首家授权开发诊断试剂的企业,也是唯一一家仪器试剂捆绑报证的单位。

目前,赛哲生物医学服务中心配备有Illumina国际主流测序平台,根据样本及通量情况,可提供iSeq、MiniSeq、MiSeq、NextSeq、NovaSeq等多种高通量平台测序服务。其中illumina MiSeq Dx、NextSeq 550Dx已通过FDA和CE-IVD注册,MiSeq Dx更通过了中国CNDA批准,可应用于临床体外诊断领域的测序服务。

illumina NovaSeq 6000

全新的NovaSeq系列测序系统,突破技术革新,具有可扩展的通量、灵活简便的配置和简化的操作流程,允许以更大的深度来发现罕见的遗传变异,为大规模发现复杂疾病变异打开了全新的市场。NovaSeq 测序平台单次运行最多可检测48个人类基因组,产出 6Tb 的数据量,运行时间缩短至40个小时。

  • 通量范围:4800-6000 Gb
  • 每次运行reads数:32-40 B
  • 最大读长:2 × 250 bp

可扩展的通量

为了满足不同用户的需求,NovaSeq系列提供两种配置。NovaSeq 5000系统为一系列广泛的应用提供成本高效益的高通量测序。NovaSeq 6000系统以每个样品最低的花费为这些应用提供前所未有的通量。无论选择哪一种系统,您都能得到与您研究相匹配的通量。

高度灵活

NovaSeq系列扩展度大、灵活简便,能够适应各种不同的应用和项目规模,同时达到最大的操作效率。用户可以同时运行1个或2个流动槽,并有4个流动槽类型可供选择, 轻松地调节每个测序运行的产出。可对数据产出灵活调节,因此您能够运行包含任何测序方法、基因组和规模的项目。

广泛的应用范围

NovaSeq系列与大部分Illumina文库制备套件相兼容,从转录组测序到全基因组测序,及其中的一切。高质量、高覆盖度的测序为基因组提供了综合的视野,能够精确发现变异、描绘异构体的特征并做更多事情。由于有着更高的通量和每个样品更低的单价,NovaSeq系列非常适合数据密集型的应用。

简化的操作

NovaSeq系列将我们台式测序仪简便易用的特点和高通量测序平台的威力结合在了一起。该系列提供了全自动机载簇生成,最大程度缩短了手动操作时间。集成的试剂盒随时可用,简化了运行设置,防止了不当上样。具有射频识别编码的耗材能够全自动追踪试剂。概括来讲,在NovaSeq 5000系统或NovaSeq 6000系统上设置一个运行只需几分钟时间,提高了您的实验室效率。

illumina NextSeq 550Dx

NextSeq 550Dx仪器已获得FDA批准和CE-IVD认证,可帮助临床实验室开发和开展广泛的应用,从使用靶向panel进行NGS IVD分析,到包含靶向panel和全基因组等的临床研究应用。

  • 产出范围:≥ 90 Gb
  • 每次运行reads数:≥ 300 M
  • 最大读长:2 × 150 bp

双操作模式,灵活性强

按照批准的测序工作流程开发诊断检测,可利用流程中未来的NGS IVD检测,同时能保持在研究环境中工作的灵活性,将多种Illumina测序方法用于广泛的应用。

临床仪器的一致性

仪器和测序试剂都已获得FDA批准,按照设计控制原则开发,生产符合现行药品生产质量管理规范(cGMP),并验证了检测性能的一致性。

在NextSeq 550Dx系统上,设计您自己的NGS方案

NextSeq 550Dx可与TruSeq Custom Amplicon Kit Dx文库制备试剂盒和NextSeq 550Dx Reagent Kit联合使用,是IVD开发工具包的一部分,可让临床实验室设计具有受监管组件的临床检测。

illumina MiSeqDx

第一个通过FDA和CE-IVD注册、中国CNDA批准的NGS平台,可用于临床体外诊断(IVD)领域。

  • 产出范围:540 Mb–15 Gb
  • 每次运行reads数:12-25 million
  • 最大读长:2 × 300 bp

经过FDA批准的NGS系统

MiSeqDx系统是第一台经过FDA批准、适用于体外诊断(IVD)检测的NGS平台。MiSeqDx仪器满足严格的性能特征,这样您能够确信您生成了准确可靠的数据。有了MiSeqDx系统,临床医生和临床实验室如今就能够获得全面可靠的DNA测序结果。

不断扩展的IVD目录

MiSeqDx系统专为临床实验室而设计,使得广泛的测序应用如今触手可及。两款经FDA批准的囊性纤维化检测目前已经上市,而一款FDA批准的通用试剂盒让您能够创建和采用您自己的NGS分子诊断检测。

轻松的NGS流程

MiSeqDx仪器提供了一个易于上手的自动化流程。直观的触摸屏界面让仪器操作倍感轻松。即插即用的试剂和RFID追踪提升了安全性和便利性。MiSeqDx仪器不需要辅助硬件和计算资源,节省了宝贵的实验室空间。

用户友好的直观软件

在您创建和设置您的样本表,然后上样测序试剂槽(预先加载试剂)时,用户友好的触摸屏界面将全程给您指导。在运行过程中,您可以监控质量统计数据。在DNA测序完成时,系统软件将分析检测数据,并生成结果报告。

illumina MiniSeq

MiniSeq系统是illumina迄今为止最简单、最小巧且最经济的解决方案。让久经考验的Illumina NGS技术来加速推进您的研究。在您自己的实验室中,按照您自己的时间表,开展范围广阔的靶向DNA和RNA应用。MiniSeq拥有直观的按键式操作和轻松的数据分析,高度灵活,可以满足各种研究需求。

  • 产出范围:1.65-7.5 Gb
  • 每次运行reads数:700-2500万条
  • 最大读长:2 × 150 bp

最经济的台式测序仪

MiniSeq系统作为我们门槛最低、最易于实现的测序解决方案,带来了久经考验的Illumina新一代测序(NGS)技术的强大功能和信心。即使是少量的样本,它也能够实现经济高效的测序。它简化的工作流程可实现对DNA和RNA的快速测序。小巧的体积可与实验室无缝整合,且不需要专门的辅助设备。

灵活的NGS系统,适合多个应用

MiniSeq系统提供了跨应用的灵活性,让研究人员能够在针对DNA和RNA应用的不同测序项目之间轻松转换,包括信号转导通路分析、实体瘤和血液肿瘤分析,以及生殖系突变分析。我们提供经过优化的数据分析流程,适合不断增长的应用生态系统。

从文库到结果的NGS简单流程

MiniSeq系统将上样即运行的操作与直观的用户界面相结合,带来了一个快速简单的NGS流程。MiniSeq系统将克隆扩增、边合成边测序和碱基检出整合在单个台式仪器中,而不再需要其他设备。只需将流动槽和试剂槽上样到MiniSeq系统中,按下按钮即可开始测序。

友好直观的软件

MiniSeq系统特有触摸屏界面和友好直观的软件。利用机载软件可以设置、启动、监控和分析测序运行。通过任何web浏览器与MiniSeq系统连接,可查看实时数据和性能指标。BaseSpace Sequence Hub让您轻松并安全地分析、存档和共享测序数据。按键式的工具简化并加速推动了信息学。

illumina iSeq

iSeq 100测序系统让新一代测序比以往更加方便和经济。它设计简洁,可提供快速、高效的低通量测序,使各种规模的实验室都能一键完成DNA和RNA测序。

  • 最大产出:1.2 Gb
  • 每次运行reads数:4 million
  • 最大读长:2 × 150 bp

经济适用的台式测序仪

iSeq 100系统拥有互补金属氧化物半导体(CMOS)技术带来的速度和性价比,以及边合成边测序(SBS)化学技术的高度准确性,让几乎所有实验室都能充分利用强大的新一代测序(NGS)技术。

利用NGS深入探索

通过提供与qPCR和桑格测序相比更高的数据分辨率和更深的覆盖度,iSeq 100系统能够实现更高的统计置信度,从而检出变异或低频率等位基因。iSeq 100系统可作为现有NGS系统的补充,或作为将NGS初次介绍给客户的产品。

提高实验室效率和自主性

iSeq 100系统提供了更强的测序能力来满足当前工作流程的需求,同时确保提供一贯可靠的Illumina数据质量。iSeq 100系统可用于执行小型项目,避免了在高通量仪器上运行较小样本批次产生的浪费,可用于在大规模运行前评估文库或进行原理论证研究。

灵活可变的NGS系统适合多种应用

iSeq 100系统能够在多种DNA和RNA测序应用之间灵活切换,包括小基因组测序、靶向基因测序和基因表达分析。它还与目前最快的文库制备流程兼容。

以上内容来自illumina官方介绍,关于仪器设备的更多详情,欢迎浏览 www.illumina.com